Praha - Nově vytvořený software umožní vědcům porovnávat rozsáhlá kvanta dat z analýz složení látek, odborníci tak budou moct mimo jiné zkoumat příčiny či mechanismy metabolických chorob. O vývoj softwaru se zasloužil mezinárodní vědecký tým, který vedl Tomáš Pluskal z Ústavu organické chemie a biochemie (ÚOCHB) Akademie věd ČR (AV ČR). Článek o softwaru s názvem MZmine 3 publikoval jeden z nejcitovanějších vědeckých časopisů Nature Biotechnology, uvedl ústav v tiskové zprávě.
Se softwarem MZmine pracují odborníci od roku 2005, jeho vývoj koriguje podle ÚOCHB téměř od začátku právě Pluskal. "MZmine se za posledních deset let etabloval jako důvěryhodný nástroj pro výzkumníky v oblasti hmotnostní spektrometrie. Jeho modulární rámec vytvořil prostor pro participaci celé komunity na vývoji kódu, což vedlo k významným pokrokům uvedeným v nově vydaném MZmine 3," sdělil spoluautor nové verze softwaru Ansgar Korf z Univerzity v Münsteru.
MZmine 3 dokáže podle ústavu zpracovat tisíce vzorků za hodinu, zatímco starší verze zpracovaly stovky vzorků během několika dní. ÚOCHB dodal, že nový typ softwaru navíc umožní kombinace různých druhů dat, například dat z analytických a zobrazovacích metod.
Software tak podle ústavu usnadní vědcům mimo jiné interpretaci komplexních biologických vzorků, výzkum metabolických i jiných chorob, identifikaci chemických látek v životním prostředí, či detekování klinických biomarkerů pro diagnostiku.
Druhá generace MZmine vznikla v roce 2010, využita byla podle ÚOCHB ke zpracování milionů různých měření. "Největší síla projektu MZmine je v mezinárodní komunitě expertů, která se kolem projektu vytvořila. Na vědeckých konferencích mají prezentace o MZmine vždy ohromný ohlas," řekl Pluskal.
